![]() |
Дерево имеет три отчетливо выделяющиеся группы (они отмечены на рисунке).
К
первой относятся миоглобины. Принадлежность двух других не известна.
Кроме этого, хорошо заметны кластеры Human-Horse-Chiсken. Белки
из организмов Danio и Xenopus не входят в состах этих кластеров и не образуют
самомтоятельных,
находятся в непосредственной близости
от корня дерева. На дереве можно выделить четыре группы ортологов
, белки каждой из которых отмечены на дереве определенным цветом.
Не
однозначны родственные связи в случаях I, II и III. 1) Глобин из Danio может с равной вероятностью относиться как к первой группе ортологов, так и ко второй. 2) К трерьей группе ортологов относится либо глобин IIa, и в этом случае IIb будет являться паралогом, либо IIb, тогда IIa явяляется паралогом. 3) Что касается беков IIIa и IIIb (отмечены голубым), то скорее всего в организме Chicken произошла поздняя дупликация, и эти белки являются близкими модификациями одного типа глобина. |
![]() | Данное дерево противоречит классическим представлениям об эволюции на ранних этапах развитяи жизни, согласно которым Archaea и Bacter произошли от одного предка и разошлись в эволюции, сформировав два из трех самых крупных доменов клеточных организмов. Однако, на представленном дереве для фермента глутаминсинтетазы видно, что расположение организмов не соответствует реальной таксономии.Это объясняется тем, что для бактерий весьма характерно явление горизонтального переноса и организмы Termotoga, Pasteurella, Escherichia могли преобрести глутаминсинтетазу с помощью этого механизма от Archaea уже после расхождения групп в процессе эволюции. |