Область на карте -phy=-62.571+15,psy=39.6+19,АК остатки 87D-91D
Данная последовательность представляет собой прав. α-спираль.
Она ,как последовательность с постоянной структурой без
изломов(закономерно изменяются значения углов.
Расположение не является переферическим |
 |
 |
Область на карте-pfy=-110+7.4,psy=129+16,АК остатки 43D-45D
Данная последовательность представляет собой β-лист с порал.
цепями.Исследуя несколько таких же последовательностей,пинадлежа-
лежащих данной области,видно,что это
такие же листы,ограничивающие сквозное отверстие.
Совокупность таких спиралей образует срутуру типа трубы
Спирали чередуются с листами,причем спирали образуют внеш-
нюю стенку полого цилиндра.Все спирали примерно одной длины
Самая длинная лежит в В-субъединице. Между собой спирали и
листы соединены участками,не имеющими определееной струк-
туры
|
Область на карте phy=-59,3+23,6,psy=145,9+25 остатки 121С-123С
соответствует пораллельным тяжам. В данном белке их не имеется,
а АК,принадлежащие этой области практически не образуют последовательностей
Исключения два :121С-123С и 121D-123D. Иследовав их можно понять, что они учавст-
вуют в связивании спиралей и тяжей
|
 | |
 | Вывод:данные аминокислоты находятся на изгибах цепи между спиралями и листами . В данной области
В данной области
наиболее часто встречается глицин,т.к.он не имеет радикала и его объем
наименьший среди всех аминокислот,поэтому именно расположение глицина
в изгибах цепи является наиболее выодным геометрически
|