Карта Рамачандрана

Работа с программой Rasmol



Область на карте -phy=-62.571+15,psy=39.6+19,АК остатки 87D-91D Данная последовательность представляет собой прав. α-спираль. Она ,как последовательность с постоянной структурой без изломов(закономерно изменяются значения углов. Расположение не является переферическим
Область на карте-pfy=-110+7.4,psy=129+16,АК остатки 43D-45D Данная последовательность представляет собой β-лист с порал. цепями.Исследуя несколько таких же последовательностей,пинадлежа- лежащих данной области,видно,что это такие же листы,ограничивающие сквозное отверстие. Совокупность таких спиралей образует срутуру типа трубы Спирали чередуются с листами,причем спирали образуют внеш- нюю стенку полого цилиндра.Все спирали примерно одной длины Самая длинная лежит в В-субъединице. Между собой спирали и листы соединены участками,не имеющими определееной струк- туры
Область на карте phy=-59,3+23,6,psy=145,9+25 остатки 121С-123С соответствует пораллельным тяжам. В данном белке их не имеется, а АК,принадлежащие этой области практически не образуют последовательностей Исключения два :121С-123С и 121D-123D. Иследовав их можно понять, что они учавст- вуют в связивании спиралей и тяжей
Вывод:данные аминокислоты находятся на изгибах цепи между спиралями и листами . В данной области В данной области наиболее часто встречается глицин,т.к.он не имеет радикала и его объем наименьший среди всех аминокислот,поэтому именно расположение глицина в изгибах цепи является наиболее выодным геометрически

Главная страница