Анализ семейства. Выбор центральных белков. Составление выборок.Создание множественного выравнивания.Предсказание аминокислотных остатков, определяющих функциональные
особенности подсемейств PyrF и SgbH.
-
- определение доменную структуру P08244.
-
- подобор гомолога P082441 из E.coli отличающегося от него по функции и/или доменной организации и/или распространенности их ортологов в разных таксонах. Отобранных гомологи - "центральные белки"
-
- выбор функциональных подсемейств для исследования.
-
Создание полного множественного выравнивания с помощью программы MUSCLE и доменного выравнивания во данным Pfam.
- Определение функционально значимых аминокислот с помощью сервера SDPPred.