База данных PFAM включает 7426 записей с краткой характеристикой разных семейств белковых доменов, включая их множественные выравнивания. Каждый домен в PFAM описан с помощью профиля HMM..
На рисунке зеленым изображен домен OMPdecase
Согласно базе данных PFAM в белке PYRF_ECOLIсуществует 1 домен.
Краткое название домена: OMPdecase
Его расположение в последовательности: 15-237
Идентификатор записи в PFAM: PF0215
Краткое описание свойств домена:
Некоторые участки последовательности OMPdecase высоко консервативны во многих организмах. Наиболее консервативная область расположена в N-концевой части OMPdecases и сосредоточена вокруг остатка лизина, который является существенным для каталитической функции фермента.Функция белка PYRF_ECOLI, имеющего этот домен,обеспечение протекания последней стадии в синтезе пиримидинов.
![]() | На рисунке прдставлено трехмерное изображение А-субъединицы белка PYRF_ECOLI в прграмме RasMol.Красным цветом отмечен домен OMPdecase , белым –участок цепи,неотносящийся к домену. |