Структура белка 4R5F

Структура в целом:

Тип макромолекулы - белок; это мутантная форма фермента цистеиндесульфуразы IscS2 из археи Archaeoglobus fulgidus.

В асимметричной единице кристалла присутствует одна полимерная цепь (A-цепь), и этот фермент является димером(Рис.1).

Во вторичной структуре больше спиралей, чем тяжей; это иллюстрирует рисунок 2.

Рис. 1. Структура димера
Рис. 2. Вторичная структура

Отдельные цепи

Как уже было сказано выше, в структуре есть одна полимерная цепь, составляющая асимметричную единицу (Рис.3).

Согласно данным базы Uniprot, данный белок (uniprot_id: O29689) относится к организму Archaeoglobus fulgidus DSM 4304 и называется цистеиндесульфуразой (сокращенно IscS2).
Даннй белок у A. fulgidus не обладает активностью цистеиндесульфуразы, предположительно он предоставляет лиганд цистеина при сборке железо-серных кластеров [1].

В последовательности есть одна мутация относительно референса из базы Uniprot: в позиции 199 находится лизин (вместо аспарагиновой кислоты).

В цепи нет модифицированных аминокислотных остатков.

Рис. 3. Одна белковая цепь
Малые молекулы

В структруе белка присутствует следующие малые молекулы (помимо молекул воды):

Рис. 4. Белковое окружение иона кальция

Использованные ресурсы:

1. Pagnier, A., Nicolet, Y., Fontecilla-Camps, J.C. (2015) Biochim Biophys Acta 1853: 1457-1463
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0167488914003747?via%3Dihub