Краткое описание генома вируса Barely stripe mosaic virus

Barley stipe mosaic virus - это палочковидный РНК-вирус из семейства Virgaviridae [1], рода Hordevirus, инфицирующий в основном растения рода Hordeum (ячмень) и Triticum (пшеница)[2]. Структура этого вируса очень похожа на стуктуру первого обнаруженного учеными вируса - Tobbaco Mosaic Virus.[1] Основными симптомами заражения является появление желтых полос или пятен, характерной "мозаичности" листьев (симптомы могут немного различаться для различных штаммов), для инфицированных растений также характерен замедленный рост. Распространяется BSMV в основном путем инфицирования семян, причем вирус может сохраняться в семенах в латентной форме в течение нескольких лет. Интересно, что вирус обнаруживается только в мезохиле и эпидермальных клетках листа, в которых он поражает хлоропласты и ядро. Не известны случаи распространения насекомыми-переносчиками.[2]

Рис.1 Внешний вид растения, пораженного BSMV [3]


Строение [4] :
Капсид вируса представляет собой спиральнозакрученный стержень диаметра 20-25 нм с центральным каналом.

Рис.2 Строение BSMV [4]


Геном [5] BSMV состоит из трех линейных ssРНК: RNA alfa кодирует 1 белок, RNA beta - 4 белка, RNA gamma - 2 белка, это[6] : супрессор РНК-сайленсинга,три двигательных белка (TGB1,2,3), Alfa-A Protein, РНК-зависимая РНК полимераза, белок капсида.
Таблица 1. Основные характеристики BSMV
Латинское название вируса Barley Stripe Mosaic virus
Русское название вируса Вирус мозаики ячменя
Количество фрагметов в полном геноме 3
Общая длина генома 10 221 п.о.
Общее количество кодируемых полипептидов 6
Количество "зрелых" вирусных белков 6

Последовательность кратчайшего белка супрессора РНК-сайленсинга (153 аминокислотных остаткa): 
>sp|Q80874|VSR_BSMV Suppressor of RNA silencing
MMATFSCVCCGTSTTSTYCGKRCERKHVYSETRNKRLELYKKYLLEPQKCALNGIVGHSC
GMPCSIAEEACDQLPIVSRFCGQKHADLYDSLLKRSEQELLLEFLQKKMQELKLSHIVKM
AKLESEVNAIRKSVASSFEDSVGCDDSSSVSKL

Рис.3 Электронная микрофотография BSMV в семени ячменя [7]

Список использованной литературы:
  1. [1] https://rybicki.wordpress.com/2013/09/11/barley-stripe-mosaic-virus-structure-and-relationship-to-the-tobamoviruses
  2. [2] https://en.wikipedia.org/wiki/Barley_stripe_mosaic_virus
  3. [3] http://cropgenebank.sgrp.cgiar.org/index.php/management-mainmenu-434/stogs-mainmenu-238/wheat/guidelines/viruses
  4. [4] http://viralzone.expasy.org/all_by_species/734.html
  5. [5] https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/30555
  6. [6] очень длинная ссылка
  7. [7] http://www.crec.ifas.ufl.edu/crec_websites/csprl/photos.shtml
Назад