PDB ID 5KA1
Скачать скрипт:5KA1
Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре
Table 1. Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре.
| # |
Имена атомов |
Длина связи (A°) |
N-O-C угол (°) |
| Альфа-спирали |
| 1 |
N(201SER)-O(197LYS) |
3.13 |
149.6 |
| 2 |
N(196PHE)-O(192LEU) |
2.85 |
157.4 |
| 3 |
N(191PHE)-O(187SER) |
3.24 |
151.6 |
| Среднее значение |
3.07 |
152.8 |
| Бета-тяжи |
| 1 |
N(118SER)-O(115GLU) |
3.1 |
118.6 |
| 2 |
N(115GLU)-O(118SER) |
2.95 |
154.7 |
| Среднее значение |
3.025 |
136.65 |
Из таблицы мы делаем вывод, что длина H-связи колеблется от 2.85 до 3.25 ангстрем. Причём, в бета тяжах связсина 0.05 короче, чем в альфа спиралях (по среднему значению из трех).
Значение углов N-O-C находятся между 149.6 и 157.4 градусами.
Но средние значения углов в альфа спиралях и бета тяжах почти совпадают.
© Григорьева Маша