Задание 1

Отобранные бактерии

НазваниеМнемоника
Proteus mirabilisPROMH
Saccharophagus degradansSACD2
Acidiphilium cryptumACICJ
Paracoccus denitrificansPARDP
Roseobacter denitrificansROSDO
Bartonella henselaeBARHE
Agrobacterium fabrumAGRFC
Rhizobium melilotiRHIME

Скобочная формула дерева

((PROMH, SACD2), (ACICJ, ((PARDP, ROSDO), (BARHE, (AGRFC, RHIME)))))

Изображение дерева

Ветви дерева

Дерево содержит пять нетривиальных ветвей:

1) {PROMH, SACD2} против {ACICJ, PARDP, ROSDO, BARHE, AGRFC, RHIME}
2) {PROMH, SACD2, ACICJ} против {PARDP, ROSDO, BARHE, AGRFC, RHIME}
3) {PARDP, ROSDO} против {PROMH, SACD2, ACICJ, BARHE, AGRFC, RHIME}
4) {BARHE, AGRFC, RHIME} против {PROMH, SACD2, ACICJ, PARDP, ROSDO}
5) {AGRFC, RHIME} против {PROMH, SACD2, ACICJ, PARDP, ROSDO, BARHE}

Таксономия

НазваниеМнемоникаОрганизацияЦарствоТипКлассОтряд Семейство Род и др группы
Proteus mirabilisPROMHcellular organismsBacteria Proteobacteria Gammaproteobacteria Enterobacterales MorganellaceaeProteus
Saccharophagus degradansSACD2cellular organismsBacteria ProteobacteriaGammaproteobacteriaCellvibrionalesCellvibrionaceaeSaccharophagus
Acidiphilium cryptumACICJcellular organismsBacteriaProteobacteriaAlphaproteobacteriaRhodospirillalesAcetobacteraceaeAcidiphilium
Paracoccus denitrificans PARDPcellular organismsBacteriaProteobacteriaAlphaproteobacteriaRhodobacterales RhodobacteraceaParacoccus
Roseobacter denitrificansROSDOcellular organismsBacteriaProteobacteriaAlphaproteobacteriaRhodobacterales RhodobacteraceaRoseobacter
Bartonella henselaeBARHEcellular organismsBacteriaProteobacteriaAlphaproteobacteriaRhizobiales BartonellaceaeBartonella
Agrobacterium fabrumAGRFCcellular organismsBacteriaProteobacteriaAlphaproteobacteriaRhizobiales Rhizobiaceae Rhizobium/Agrobacterium group (no rank)
Agrobacterium (род)
Agrobacterium tumefaciens complex (species group)
Rhizobium melilotiRHIMEcellular organismsBacteriaProteobacteriaAlphaproteobacteriaRhizobiales RhizobiaceaeSinorhizobium/Ensifer group (no rank)
Sinorhizobium (род)

Нетривиальные ветви на полученном дереве выделяют следующие таксономические группы:

{AGRFC, RHIME} = семейство Rhizobiaceae
{BARHE, AGRFC, RHIME} = отряд Rhizobiales
{PARDP, ROSDO} = семейство Rhodobacteracea
{ACICJ, PARDP, ROSDO, BARHE, AGRFC, RHIME} = класс Alphaproteobacteria
{PROMH, SACD2} = класс Gammaproteobacteria
© Grigorjeva Masha