На главную

Описание пространственной структуры DEF_ECOLI по данным банка PDB, код 1bs6

показывает положение всех молекул комплекса
На рисунке отмечены содержащиеся в моем белке молекулы: цепь А,B,C,D,E,F
load H:\term1\creditworks\credit2\1ALN.PDB
   

script H:\term1\creditworks\credit2\1bs6.def
background white
select *d
wireframe 50
color cpk
select mas
wireframe 80
color cyan
pause
select *a
color cpk
wireframe 50
pause
restrict *a,*d
center *d
pause
restrict *d,97:a,89:a,88:a,132:a,133:a,44:a,43:a,45:a
zoom 630
rotate x -70
color green
select *d
color cyan
pause
select arg97:a.nh1, arg97:a.nh2, ser3:d.o, ser3:d.oxt, glu133:a.oe2,
 glu133:a.oe1, met1:d.n, ile44:a.n, met1:d.o
cpk 100
color cpk
pause
restrict mas, 133, 97
select arg97:a.cg
label % AA1
select glu133:a.cb
label % AA2
select ala2:d.o
label % MAS
set fontstroke 1
set fontsize 10

Этот скрипт показывает 
основные взаимодействия 
моего лиганда MAS 
с окружающими остатками. 

Вначале можно увидеть 
все остатки, взайимодействующие 
с лигандом, и сам лиганд. 

После нажатия клавиши Enter 
есть возможность увидеть 
расположение лиганда внутри 
белка. 

 

© Андреева Мария, 2004