показывает положение всех молекул комплекса | На рисунке отмечены содержащиеся в моем белке молекулы: цепь А,B,C,D,E,F |
load H:\term1\creditworks\credit2\1ALN.PDB script H:\term1\creditworks\credit2\1bs6.def background white select *d wireframe 50 color cpk select mas wireframe 80 color cyan pause select *a color cpk wireframe 50 pause restrict *a,*d center *d pause restrict *d,97:a,89:a,88:a,132:a,133:a,44:a,43:a,45:a zoom 630 rotate x -70 color green select *d color cyan pause select arg97:a.nh1, arg97:a.nh2, ser3:d.o, ser3:d.oxt, glu133:a.oe2, glu133:a.oe1, met1:d.n, ile44:a.n, met1:d.o cpk 100 color cpk pause restrict mas, 133, 97 select arg97:a.cg label % AA1 select glu133:a.cb label % AA2 select ala2:d.o label % MAS set fontstroke 1 set fontsize 10 |
Этот скрипт показывает основные взаимодействия моего лиганда MAS с окружающими остатками. Вначале можно увидеть все остатки, взайимодействующие с лигандом, и сам лиганд. После нажатия клавиши Enter есть возможность увидеть расположение лиганда внутри белка. |
© Андреева Мария, 2004