На главную страницу второго семестра 

Банки данных Swiss-Prot и UniProt


Данные банка Swiss-Prot о белке DEF_ECOLI

 
Информация Метка поля (line code) Запись
Внутренний уникальный постоянный идентификатор документа AC P27251
Стандартное имя последовательности (идентификатор последовательности) ID DEF_ECOLI
Название белка, отражающее его функции DE Peptide deformylase ( Пептиддеформилаза )
Дата создания документа DT 1 августа 1992 г.
Дата последнего исправления аннотации DT 1 мая 2005 г.
Название организма OS Escherichia coli
Полное название таксона OC Bacteria
Proteobacteria
Gammaproteobacteria
Enterobacteriales
Enterobacteriaceae
Escherichia
Длина последовательности SQ 168 аминокислотных остатков
Молекулярная масса белка SQ 19197 г/моль
Число публикаций, использованных при создании документа RN 13
Название журнала с самой свежей публикацией RL
Biochemistry 38:4712-4719(1999).
Описание вторичной структуры SQ В описании вторичной структуры белка указаны длина последовательности, её молекулярный вес и аминокислотный состав.
Что содержит поле комментариев? CC Поле комментариев содержит информацию о Функции, каталитической активности, типе белка и его принадлежности к какому-либо семйству.
Какие особенности последовательности указаны? FT Указано общее количество α-спиралей и β-листов и поворотов, их начальный и конечный номера аминокислотных остатков.
Идентификатор файла PDB DR Существует несколько PDB-файлов соответствующих данной последовательности аминокислот: 1BS4, 1BS5, 1BS6, 1BS7, 1BS8, 1BSJ, 1BSK, 1BSZ, 1DEF, 1DFF, 1DTF, 1G27, 1G2A, 1ICJ, 1LRU, 2DEF, 2DTF


Описание белка DEF_ECOLI в банке данных Swiss-Prot  


Результаты поиска в БД UniProt белков с тем же кратким описанием (DE), что и у белка DEF_ECOLI

Поиск произведен с помощью поисковой системы SRS (Sequence Retrieval System) .

Таксон Запрос Количество найденных документов
Археи (Archaea) "-" 0
Бактерии (Bacteria) "((([uniprot-Description:Peptide*] & [uniprot-Description:deformylase*]) | [uniprot-Description:Peptide deformylase*]) & [uniprot-Taxonomy:Bacteria*]) " found 221 entries " 221
Эукариоты (Eukaryota) "((([uniprot-Description:Peptide*] & [uniprot-Description:deformylase*]) | [uniprot-Description:Peptide deformylase*]) & [uniprot-Taxonomy:Eukaryota*]) " found 8 entries " 8


Андреева Мария,2005