Практикум 3

Структура в целом

Представленная мной молекула – белок 6-гидроксиметил-7,8-дигидроптеринпирофосфокиназа (HPPK) Escherichia coli в комплексе с AMPCPP (5ЕТК). HPPK (Рис. 1) является участником пути биосинтеза фолата, обнаруженного у прокариот и низших эукариот, который катализирует перенос пирофосфорила от кофактора АТФ к субстрату 6-гидроксиметил-7,8-дигидроптерина.

В структуре присутствует одна полимерная цепь, соответственно, она единолично составляет одну биологическую единицу. Молекула не отличается от асимметрической.

uniprot_id: P26281

Мутации в последовательности отсутствуют. Вторичная структура представлена альфа- и бета-элементами (а + b) (Рис. 2). Модифицированных аминокислотных остатков нет.

Малые молекулы

Помимо воды и белка, в записи присутствуют также молекула APC (diphosphomethylphosphonic acid adenosyl ester) и молекула 5RU (2-azanyl-8-[(2-fluorophenyl)methylsulfanyl]-1,9-dihydropurin-6-one), а также атомы кальция и хлора

Ссылки на pdb-файлы с малыми молекулами: