Задание 2
Для анализа структуры была взята B-форма ДНК и цитозин (C9).
A‑форма | B‑форма | Z‑форма | |
---|---|---|---|
Тип спирали | правая | правая | левая |
Шаг спирали (Å) | 28.0 | 33.8 | 43.5 |
Число оснований на виток | 11 | 10 | 12 |
Ширина большой бороздки | 17.0 (A:G13-B:T31) | 17.9 (A:A6-B:T31) | 18.3 (A:C6-B:C32) |
Ширина малой бороздки | 8.0 (A:T3-B:C32) | 11.7 (A:T15-B:A30) | 7.2 (A:G11-B:G33) |
Задание 3
Для выполнения задания была взята структура тРНК 1ffy и использованы программы пакета 3DNA (find_pair и analyze).
Из файла 1ffy.out была извлечена полная информация о водородных связях, присутствующих в структуре тРНК, ее можно посмотреть здесь.
Пары нуклеотидов, образующие стебли:
Неканонические пары:
Дополнительные водородные связи: