На главную страницу вторго семестра

InterPro

  1. IPR002355
  2. Multicopper oxidase, copper-binding site
  3. В документе два мотива соответствующие обоим доменам: PS00079 MULTICOPPER_OXIDASE1 (голубая медь, 1150 белков, но, судя по поиску по prosite (по данному паттерну cueo_ecoli не находится) и по следующему заданию - в нем этого мотива нет, даннй мотив в моем белке отсутствует, несмотря на присутствие соответствующего ему домена) и PS00080 MULTICOPPER_OXIDASE2 (биядерный центр, 693 белка).

Взаимоотношение данных подписей (мотивов) описаны в предыдущем задании

Изображение всех мотивов в последовательности (почему-то опять нет мотива PS00079):
Название подписиПоложение в последовательности CUEO_EcoliПолное название базы данныхНазвание организации, поддерживающей данную БД.Город и страна
MULTICOPPER_OXIDASE2499-510PROSITESwiss Institute of BioinformaticsШвейцария, Женева
TAT_signal_seq1-28TIGRFAMsThe Institute for Genomic ResearchRockville, Окург Колумбия, США
Cupredoxins
1-173
174-285
441-502
503-516
SuperFamilyThis server is maintained by Derek Wilson at the MRC Laboratory of Molecular Biology, Cambridge, Martin Madera at the European Bioinformatics Institute, Hinxton, and Julian Gough at Stanford UniversityСША
Cu-oxidase_2378-516PfamSanger InstituteВеликобритания, Кэмбридж
Cu-oxidase_351-167PfamSanger InstituteВеликобритания, Кэмбридж

©Павел, Мазин