На главную страницу третьего семестра

Информация банка EMBL о гене белка CUEO_ECOLI

  1. Разделы банка EMBL:
    envEnvironmental Sample356418
    funГрибные1361355
    humЧеловеческие 10712210
    invБеспозвоночные7885866
    mamДругие млекопитающие6064643
    musMus musculus7117246
    phgБактериофагные4179
    plnРастения17894905
    proПрокариоты472226
    rodДругие грызуны1395377
    synСинтетические 679561
    uncНеклассофицированные1204568
    vrlВирусные404741
    vrtДругие позвоночные6540424
  2. Воспользоваться программой entret для embl не удалось так как всегда был timeout. В документе sw есть следующий текст про embl: 
    DR   EMBL; U00096; AAC73234.1; -; Genomic_DNA.
DR   EMBL; AP009048; BAB96698.2; -; Genomic_DNA.

    Записи EMBL, описывающие последовательности, кодирующие белок multicopper oxidase (laccase)

      I II
    ID AAC73234_2; parent: U00096.2 BAB96698; parent: AP009048.1
    AC    
    Тип молекулы (ДНК/РНК) linear genomic DNA linear genomic DNA
    Длина посл-ти в записи 1551 1551
    Раздел банка Prokaryotes Prokaryotes
    Начало гена в записи в(Parent Accession) 137083 137083
    Конец гена в записи 138633 138633
    Направление гена прямое прямое
    Дата последнего изменения документа 09-SEP-2006 (это дата изменения U00096) 20-JUN-2006 (это дата изменения AP009048)
    Примечания    

    Эти записи фактически одинаковые, отличается только организм: U00096.2 - Escherichia coli K12, а AP009048.1 - Escherichia coli W3110. В чем принципиальное отличие между ними не ясно. При поиске по discription "multicopper oxidase (laccase)" находится 37 документов, но среди них нет этих.
  3. Последовательности абсалютно идентичны: выравнивание
©Павел, Мазин