Практикум 6. Поиск блоков в выравнивании
Ссылка на проект JalView: blocks.jvp.
Протокол
ID домена: VCIP135_N
AC: PF19437
Число последовательностей в выравнивании seed: 17
Число последовательностей в выравнивании full: 256
- Вертикальный плюс-блок. Позиции выравнивания: от 98 до 122 колонки. Паттерн: [VLI][KR][VF].G[LIMV][ST]NY.C[KS][LIS][LIV]S[FPH][VIL]L[TAS].[YH]G[MK]D[KR]
- Частичный плюс-блок. Позиции выравнивания: от 81 до 85 колонки, первые 13 строчек. Паттерн: [AILV]L[VLM][GSE][NTV]
- Минус-блок. Позиции выравнивания: от 36 до 40 колонки.