Филогенетические деревья
Итак, что такое филогенетическое дерево? Филогенетическое дерево (эволюционное дерево, дерево жизни) — дерево, отражающее эволюционные взаимосвязи между различными видами или другими сущностями, имеющими общего предка. [1] Представим пример вид дерева на конкретных видах бактерий.
Таблица 1 Отобранные бактерия
Построим по выбранным бактериям, филогенетическое дерево.
Изображение 1.1 Изображение дерева бактерий представленных в Таблице 1
Изображение 1.2 Изображение дерева бактерий представленных в Таблице 1
Данное дерево можно представить в виде скобочной формулы. Скобочная формула дерева:
((CLOTE, CLOB1), (LACAC, ((BACAN, GEOKA), (STAA1, STAES))));
Длина ветвей была выбрана случайным образом.Нетривиальные ветви дерева:
{LACAC, BACAN, GEOKA, STAA1, STAES} против {CLOTE, CLOB1}
{BACAN, GEOKA} против {CLOTE, CLOB1, STAA1, STAE, SLACAC}
{STAA1, STAES}против {LACAC, CLOTE, CLOB1, BACAN, GEOKA}
{CLOTE, CLOB1, LACAC} против {STAA1, STAES, BACAN, GEOKA}