Изучение файла структурных факторов
1GD1
Для структуры 1GD1 указано следующее резршение 1.80 Å при полноте данных 80.1 % в интервале 18.81 - 1.80 1.80 Å. Для структуры с базы данных RCSB PDB был получент CIF-файл, информацию из которого я зафиксировал в Excel-файле
В файле находятся 116 031 измеренных структурных факторов, среди них 116 031 фактора, использовавшихся для оптимизации модели (для них указан "o" в колонке _refln.status). В файле отсутствуют измерения для некоторых троек структурных факторов. Неизмеренными направлениями считаются такие тройки чисел (h, k, l), для которых (1) нет данных в файле структурных факторов и (2) присутствует хотя бы одна тройка (h', k', l') с индексами не меньше (h, k, l) с измеренными структурными факторами.
Рис 1 Часть таблицы структурных факторов для структуры 1GD1
В файле целые числа h, k, l - три колонки представляют значения в колонках _refln.index_h _refln.index_k _refln.index_l
F - среднее значение измерений структурного фактора _refln.F_meas_au
F_sigma - ср. кв. отклонение от среднего _refln.F_meas_sigma_au
могут быть и другие колонки:
_refln.status - использован ли структурный фактор для оптимизации модели
Очень странно, что в файле нет ни структурных факторов, использованных для построения модели(f), ни неизмеренных структурных факторов (x). Возможно это связанно, с тем, что файл был сделан в 2013 году, а структуру получали в 2002, и какие-то данные уже утерелясь.
1_0 2002-05-08 'Initial release'
1_1 2013-12-11 'Format standardization'