Характеристика паттерна | Паттерн | В скольких последовательностях банка Swiss-Prot найден мотив, удовлетворяющий паттерну? | Все ли последовательности из Вашего выравнивания найдены? |
Фрагмент последовательности | G-Y-R-V-E-S-L-A-R-I-Q-S-L-E-E-G-K-V-S-F-V-Q-E | 1 | нет |
Сильный | G-[YI]-R-V-E-S-L-A-[RI]-[VI]-[AEKQ]-S-L-[ASE]-[GDE]-[NSG]-[VTQK]-V-[TRES]-F-[IKV]-[KEQ]-[DE>] | 15 | да |
Слабый | G-X-R-[VI]-E-S-L-A-[RI]-[VI]-X-S-L-[ASET]-[GDE]-[NSAG]-X(1,5)-F-[IKVA]-X-[DNE>] | 19 | да |
Идентификатор документа PROSITE (AC) | Название мотива | Краткое описание мотива | Тип подписи (паттерн, профиль) | Паттерн (регулярное выражение) | Специфична ли подпись? | Сколько мотивов нашлось в белке? |
PS00008 | MYRISTYL | Сайт N-миристоилирования | паттерн | G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} | неспецифична | 5 |
PS00006 | CK2_PHOSPHO_SITE | Сайт фосфорилирования Казеин киназы II | паттерн | [ST] - x(2) - [DE] | неспецифична | 3 |