head
первый семестрвторой семестр главная страница

A- и В- формы ДНК. Структура РНК

Задание 2

  1. 1gts - Разрывов нет
  2. 1pp8 - Есть разрывы, изза того, что структура действительно содержит несколько фрагментов.

Задание 3

Упражнение 1

  1. В сторону большой бороздки обращены атомы t11.o4, t11.c5m
  2. В сторону малой бороздки обращены атомы t11.o2
  3. Остальные атомы основания t11.n1,t11.c2,t11.n3,t11.c4,t11.c5,t11.c6

Упражнение 2
 A-формаB-форма*Z-форма
Тип спирали (правая или левая) правая правая левая
Шаг спирали (Å) 28,0133,7544,2
Число оснований на виток 121112
Ширина большой бороздки 16,8117,217,20
Ширина малой бороздки 7,9811,697,20

Упражнение 3
Сравнение торсионных углов в А- и B- формах
Углы α β γ δ ε ξ χ
А-форма
Презентация		 -62 173 52 88 или 3 178 -50 -160
А-форма
RasMol		 -51.71 174.79 41.72 79.08 -147.78 -75.12 -157.20
B-форма
Презентация		 -63 171 54 123 или 131 155 -90 -117
B-форма
RasMol		 -29.87 136.38 31.10 143.42 -140.77 -160.52 -97.95

Задание 4

Упражнение 1
  1. углы почти не отличаются
  2. Структура тРНК больше похожа на структуру А-формы
  3. Углы α β γ δ ε ξ χ
    A-форма
    RasMol    		 -51.71 174.79 41.72 79.08 -147.78 -75.12 -157.20
    Углы самого кривого нуклеотида 4G strand I 171.8 -172.1 172.4 81.2 -131.2 -73.7 -176.5
Упражнение 2
  1. Акцепторный стебель - 5' 2-7 3' и 5' 66-71 3'
    T-стебель - 5' 49-53 3' и 5' 61-65 3'
    D-стебель - 5' 10-12 3' и 5' 23-25 3'
    Антикодоновый стебель - 5' 26-33 3' и 5' 37-44 3'
  2. U-**--A, A-*---U, A-**--U, G-**+-C - канонические пары, но неканоническое взаимодействие
    U-**+-G, U-*---U, C-*---A, A-**+-A - неканонические пары
  3. Есть дополнительные водородные связи в тРНК, стабилизирующие ее третичную структуру - 19G-C56, 54U-A58, 55U-G18, 13A-A45, 14A-U8, 15G-C48
Упражнение 3
Стекинг-взаимодействие

Правильный CSS! Valid HTML 4.01 Transitional

© Almukhametov Azat