head
первый семестрвторой семестр главная страница

Комплексы ДНК-белок

Задание 1. Поиск ДНК-белковых контактов в заданной структуре

  1. скрипт
  2. Контакты атомов белка с Полярные Неполярные Всего
          остатками 2'-дезоксирибозы 9 53 62
          остатками фосфорной кислоты 38 45 83
          остатками азотистых оснований со стороны большой бороздки 9 9 18
          остатками азотистых оснований со стороны малой бороздки 5 1 6

Задание 2. Предсказание вторичной структуры заданной тРНК

Участок структуры
Позиции в структуре
(по результатам find_pair)
Результаты предсказания
с помощью einverted
Результаты предсказания
по алгоритму Зукера
Акцепторный стебель 5' 2-7 3'
5' 66-71 3'
Всего 6 пар
5' 1-6 3'
5' 64-69 3'
Всего 6 пар
5' 1-6 3'
5' 64-69 3'
Всего 6 пар
D-стебель 5' 10-12 3'
5' 23-25 3'
Всего 3 пары
  5' 9-11 3'
5' 21-23 3'
Всего 3 пары
T-стебель 5' 49-53 3'
5' 61-65 3'
Всего 5 пар
  5' 47-51 3'
5' 59-63 3'
Всего 5 пар
Антикодоновый стебель 5' 26-33 3'
5' 37-44 3'
Всего 8 пар
  5' 25-29 3'
5' 37-41 3'
Всего 5 пар
Общее число канонических пар нуклеотидов 20   19

Правильный CSS! Valid HTML 4.01 Transitional


© Almukhametov Azat