Контакты атомов белка с | Полярные | Неполярные | Всего |
остатками 2'-дезоксирибозы | 9 | 53 | 62 |
остатками фосфорной кислоты | 38 | 45 | 83 |
остатками азотистых оснований со стороны большой бороздки | 9 | 9 | 18 |
остатками азотистых оснований со стороны малой бороздки | 5 | 1 | 6 |
Участок структуры |
Позиции в структуре (по результатам find_pair) |
Результаты предсказания с помощью einverted |
Результаты предсказания по алгоритму Зукера |
Акцепторный стебель | 5' 2-7 3' 5' 66-71 3' Всего 6 пар |
5' 1-6 3' 5' 64-69 3' Всего 6 пар |
5' 1-6 3' 5' 64-69 3' Всего 6 пар |
D-стебель | 5' 10-12 3' 5' 23-25 3' Всего 3 пары |
5' 9-11 3' 5' 21-23 3' Всего 3 пары |
|
T-стебель | 5' 49-53 3' 5' 61-65 3' Всего 5 пар |
5' 47-51 3' 5' 59-63 3' Всего 5 пар |
|
Антикодоновый стебель | 5' 26-33 3' 5' 37-44 3' Всего 8 пар |
5' 25-29 3' 5' 37-41 3' Всего 5 пар |
|
Общее число канонических пар нуклеотидов | 20 | 19 |