Эволюционные домены. Pfam
Сведения о выбранном домене
1) Phosphoribosyl transferase domain - домен фосфорибозил трансферазы (PF00156)
2) 18859 последовательностей с данным доменом.
3) 49 архитектур содержат данный домен.
4) Кол-во последовательностей по царствам:
| Археи |
Бактерии |
Эукариоты |
Вирусы |
| 474 |
12771 |
1346 |
14 |
Выбраны были домены: GATase_2, Pribosyltran
Excel файл по обработке архитектур
Выравнивание выбранных послевательностей
Скобочная формула дерева в формате .tre
Полученное дерево:
По полученному дереву видно четкое разделение по количеству доменов (слева все белки с 1 доменом, справа с 2). Это говорит о том, что домены одинаковой архитектуры, но разных таксонов, судя по всему, тяготеют друк к другу больше, чем разные архитектуры из одного таксона. И это определенным образом указывает на сцепленную эволюцию.
© Almukhametov Azat