head
главная страница

Вычисление валентных параметров для молекулярной механики

Дана оптимизированная струтура этана. Задача - определить константы ковалентных взаимодействий. Для этого построим зависимость энергии молекулы от каждого из трех параметров: длина C-C связи, валентный угол HCH, торсионный угол d3.

  1. Длина С-С связи
  2. Пусть длина С-С связи варьируется от 1.32986 до 1.72986 ангстрем с шагом 0,02 ангстрема.
    Скрипт для вычисления 21 значения энергии.
    Итоговые значения энергии.

    Зависимость энергии от длины связи:

    Подобранная кривая описывается уравнением f(x)=a + k*x*x - 2*k*x*b + k*b*b
    Где

    a = -79.7652

    k = 0.563608

    b = 1.55432
    Кривая не везде совпадает со значениями энерии, так как квадратный трехчлен - симметричен относительно минимума, а энергия меняется по-разному при уменьшении/увеличении длины связи.

  3. Валентный угол HCH
  4. Пусть угол HCH варьируется от 109.2 до 113.2 градусов с шагом 0,2 градуса.
    Скрипт для вычисления 21 значения энергии.
    Итоговые значения энергии.

    Зависимость энергии от длины связи:

    Подобранная кривая описывается уравнением f(x)=a*x*x + b*x +c
    Где

    a = 3.56076e-05

    b = -0.00793196

    c = -79.3229

  5. Торсионный угол d3
  6. Пусть угол варьируется от -180 до 180 с шагом 12 градусов.
    Скрипт для вычисления 31 значения энергии.
    Итоговые значения энергии.

    Зависимость энергии от длины связи:
    Кривая похожа на синусоиду.
    Имеютя три точки минимума (60, -60 и 180 градусов).

Правильный CSS! Valid HTML 4.01 Transitional


© Almukhametov Azat