Белок GLPK_ECOLI...

  • Краткое название белка —GLPK_ECOLI
  • Полное название организма — Escherichia coli K-12
  • Название гена —gipK
  • Номер локуса в бактериальной хромосоме —b3926
  • Последовательность в формате FASTA 
    
>GLPK_ECOLI
TEKKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQ
IAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHV
EGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRS
SEVYGQTNIGGKGGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIAC
GPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARG
AIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVR
EVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEHDE

    Мои вычисления с помощью Excel

    Aминокислотный состав белка
    A Аланин 9%
    D Аспарагиновая к-та 5.3%
    E Глутаминовая к-та 7.9%
    H Гистидин 1.7%
    C Цистеин 0.9%
    K Лизин 4.3%
    N Аспарагин 3.9%
    G Глицин 8.5%
    Q Глутамин 3.9%
    F Фенилаланин 2.7%
    I Изолейцин 6.7%
    R Аргинин 6.3%
    L Лейцин 7.1%
    M Метионин 2.9%
    P Пролин 2.7%
    S Серин 4.1%
    T Треонин 7.3%
    W Триптофан 2.5%
    Y Тирозин 3.5%
    V Валин 7.1%
    		Длина последовательности —502 а.о.

    Молярная масса —56238.26 г/моль

    Средний заряд молекулы при pH=7.0 — -11.92

    Отношение содержания гидрофильных остатков к гидрофобным —0.97. Преобладание гидрофобных остатков нал гидрофильными незначительно и близко к среднему для E.coli. Учитывая это, а также то, что белок сравнительно небольшой, его нельзя считать мембранным.
    D 0.053 A 0.091
    E 0.079 C 0.009
    H 0.017 F 0.027
    K 0.043 I 0.067
    N 0.039 L 0.071
    Q 0.039 M 0.029
    R 0.063 V 0.071
    S 0.041

    На главную страницу первого семестра

    На главную
    © Кузеванов Алексей,2005