Uniprot ID | F7IX06_9ACTN |
Uniprot AC | F7IX06 |
Refseq ID | - |
PDB ID | 3VIS |
Длина | 300 AA |
Молеклярная масса | 32353 MW |
Рекомендуемое Uniprot название | Esterase |
Комментарии к таблице: Unreviewed. Состоит из двух цепей. Есть лиганд.
Класстеры
Идентификатор кластера | Имя | Количество белков в кластере | Длина | Организм |
UniRef100_F7IX06 | Esterase | 1 | 300 | Thermobifida alba |
UniRef90_F7IX06 | Esterase | 2 | 300 | Thermobifida alba |
UniRef50_W0TJ64 | Cutinase | 329 | 304 | Много |
Видно, что для кластеров с высоким процентом сходства (90 и 100) надено очень мало белков (2 и 1 соответственно) и при том оба у одного организма. В то время как белков, относящихся к кластеру, имеющему сходство с исследуемым белком в 50 процентов, сравнительно много (329) и представлены они в разных организмах.
Сеансы поиска в Uniprot
Цель запроса | Текст запроса | Количество найденных белков | Reviewed |
Поиск по рекомендованному названию | name:esterase | 60 165 | 686 |
Поиск по тому же названию среди белков из организмов того же семейства | name:esterase taxonomy:nocardiopsaceae | 41 | 0 |
Поиск по тому же названию среди белков из организмов того же отдела | name:esterase taxonomy:actinobacteria | 10 865 | 11 |
Поиск по названию гемоглобин в таксоне позвоночные (Vertebrata) | name:hemoglobin taxonomy:vertebrata | 2 442 | 821 |
Поиск по названию цитохром в таксоне инфузории (Ciliophora) | name:cytochrome taxonomy:ciliophora | 1 251 | 6 |
Поиск по названию трипсин | name:trypsin | 10 858 | 301 |
Поиск, позволяющий различить трипсин и его ингибиторов | name:trypsin NOT name:inhibitor | 8 503 | 98 |
Данные результаты позволяют сказать, что белков относящихся к эстеразам в целом довольно много (60165), и довольно значительную часть из этих белков составляют эстеразы, встречающиеся среди отдела актинобактерий (10865, что составляет 18,06%). Однако в семействе nocardiopsaceae данные белки прдеставлены довольно плохо (41, что составляет 0,07%).
Страница находится в стадии разработки