Вернуться на главную страницу

Второй семестр

Uniprot protein

Uniprot IDF7IX06_9ACTN
Uniprot ACF7IX06
Refseq ID-
PDB ID3VIS
Длина300 AA
Молеклярная масса32353 MW
Рекомендуемое Uniprot названиеEsterase

Комментарии к таблице: Unreviewed. Состоит из двух цепей. Есть лиганд.

Класстеры

Идентификатор кластераИмяКоличество белков в кластереДлинаОрганизм
UniRef100_F7IX06Esterase1300Thermobifida alba
UniRef90_F7IX06Esterase2300Thermobifida alba
UniRef50_W0TJ64Cutinase329304Много

Видно, что для кластеров с высоким процентом сходства (90 и 100) надено очень мало белков (2 и 1 соответственно) и при том оба у одного организма. В то время как белков, относящихся к кластеру, имеющему сходство с исследуемым белком в 50 процентов, сравнительно много (329) и представлены они в разных организмах.

Сеансы поиска в Uniprot

Цель запросаТекст запросаКоличество найденных белковReviewed
Поиск по рекомендованному названиюname:esterase60 165686
Поиск по тому же названию среди белков из организмов того же семействаname:esterase taxonomy:nocardiopsaceae410
Поиск по тому же названию среди белков из организмов того же отделаname:esterase taxonomy:actinobacteria10 86511
Поиск по названию гемоглобин в таксоне позвоночные (Vertebrata)name:hemoglobin taxonomy:vertebrata2 442821
Поиск по названию цитохром в таксоне инфузории (Ciliophora)name:cytochrome taxonomy:ciliophora1 2516
Поиск по названию трипсинname:trypsin10 858301
Поиск, позволяющий различить трипсин и его ингибиторовname:trypsin NOT name:inhibitor8 50398

Данные результаты позволяют сказать, что белков относящихся к эстеразам в целом довольно много (60165), и довольно значительную часть из этих белков составляют эстеразы, встречающиеся среди отдела актинобактерий (10865, что составляет 18,06%). Однако в семействе nocardiopsaceae данные белки прдеставлены довольно плохо (41, что составляет 0,07%).

Страница находится в стадии разработки


© Матвейшина Елена, 2015