Вернуться на главную страницу

Второй семестр

Протеомы и EMBOSS

Протеом Saccharomonospora viridis DSM 43017. Идентификатор протеома UP000000841. Число последовательностей - 3828. Число аминокислотных остатков - 1244168.

Протеом Escherichia coli К 12. Идентификатор протеома UP000000625. Число последовательностей - 4306. Число аминокислотных остатков - 1329107.

Таблица "Проценты содержания различных аминокислот в протеомах Saccharomonospora viridis DSM 43017 и Escherichia coli К 12

АминокислотыSaccharomonospora viridis DSM 43017Escherichia coli К 12Разность
A12,1247%9,5174%2,6073%
L10,3179%10,6900%-0,3721%
V9,2590%7,0896%2,1694%
G8,8413%7,3591%1,4822%
R8,0604%5,5094%2,5510%
E6,4308%5,7581%0,6727%
D6,2255%5,1436%1,0819%
T6,1240%5,3771%0,7469%
P5,7855%4,4408%1,3447%
S5,3376%5,7851%-0,4475%
I3,5412%6,0252%-2,4840%
F2,8506%3,9070%-1,0564%
Q2,6978%4,4413%-1,7435%
H2,2419%2,2603%-0,0184%
K2,1684%4,4115%-2,2431%
Y2,0758%2,8476%-0,7718%
N1,9562%3,9261%-1,9699%
M1,7467%2,8229%-1,0762%
W1,4486%1,5249%-0,0763%
C0,7659%1,1630%-0,3971%
U0,0001%0,0000%0,0001%

Три самых редких аминокислоты в обоих протеомах совпадают. Это селеноцистеин (U), цистеин (С) и трпитофан (W). Тогда как три наиболее частые аминокислоты совпадают лишь частично. В обоих протеомах чаще всего встречаются аланин (А) и лейцин (L). У Saccharomonospora viridis DSM 43017 третье место занимает валин (V), а у Escherichia coli К 12 глицин (G) Наибольшая разница для данных двух протеомов наблюдается в содержании аланина (А), которая составляет 2,6073%

Страница находится в стадии разработки


© Матвейшина Елена, 2015