Ha главную страницу четвертого семестра
Метаболические пути. KEGG.
К заданию 1
Субстрат |
O-сукцинил-L-гомосерин |
Продукт |
Гомосерин |
Уравнение реакции |
Succinyl-CoA + L-Homoserine <=> CoA + O-Succinyl-L-homoserine |
Изображение реакции с помощью структурных формул |
можно посмотреть здесь |
Название фермента |
- гомосериновая O-сукцинилтрансфераза
- гомосериновая О-транссукцинилаза
|
Код фермента и его расшифровка |
2.3.1.46
- EC 2 - трансфераза.
- EC 2.3 переносит ацильные группы.
- Ферменты группы EC 2.3.1 переносит группы, отличные от аминоацильной.
|
Название метаболического пути |
Предложены два метоболических пути:метаболизм метионина и метаболизм серы |
В метаболизме серы гомосерин рассматривается как субстрат, затем, после образования О-сукцинил-L-гомосерина, образуется цистотионин.В данном метаболическом пути гомосерин не образуется, а приходит из других метаболических путей. |
В метаболизме метионина реакция обратима. Гомосерин можно получит в результате реакций метаболического пути глицина, серина и треонина,а в пределах данного пути - из О-ацетил-L-гомосерина.В результате реакции можно получить цистотионин, оксибутаноат, L-гомоцистеин. |
К упражнению 2
Рассматривался фрагментметаболизма цистеина
Сравним два фермента, участвующие в данной реакции:
Код |
4.4.1.8 |
4.4.1.1 |
Название фермента |
- цистотионин бета-лиаза
- бета-цистотиаза
- цистеиновая лиаза
|
- цистотионин гамма-лиаза
- гомосериновая дезаминаза
- гомосериновая дегидротаза
- цистеиновая десульфидаза
- гамма-цистатионаза
- цистеиновая лиаза
-
|
Класс фермента |
Карбокси-сернистые лиазы |
Карбокси-сернистые лиазы |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Однако, странно говорить о том, что данные ферменты катализируют одну и ту же реакцию,
если при более внимательном рассмотрении оказывается, что если субстраты частично совпадают
(как совпадают один оптический изомер и рацемат),
а основные продукты отличаются на одну (-CH2) группу(L-гомоцистеин и L-цистеин).
Они имеют общий кофактор фосфат пиридоксала.Данные ферменты являются единственными
предложенными ортологами друг друга и имеют общие мотивы.
Cравнение метаболических путей у разных организмов
Был рассмотрен биосинтез триптофана из хоризмата у E.coli K-12 и
внутриклеточного паразита Rickettsia prowazekii.
|
Как указано на карте, у Е.соli имеются все ферменты для данной последовательности реакций,
у Rickettsia prowazekii утрачена вся необходимая для данной реакции ферментативная система, что не удивительно, так
как у большинства паразитов происходит адаптационная деградация систем органов и синтетических процессов,
т.к.вещества, необходимые для жизни паразит получает от хозяина.
|
©
Yuminova Alina aka Melli, 2006