Краткое описание генома вируса Potato virus A

Систематическое положение [1]

  • Viruses
  • ssRNA viruses
  • ssRNA positive-strand viruses, no DNA stage
  • Potyviridae
  • Potyvirus
  • Фотографии [5]

    Различные проявления заражения вирусом Potato virus A




    Таблица 1. Основные параметры генома вируса “Potato virus A”
    Латинское название вируса Potato virus A
    Русское название вирусаА вирус картофеля
    Количество фрагментов в полном геноме1
    Общая длина генома (п.н.)9585
    Количество кодируемых в геноме белков2

    Аминокислотная последовательность одного из белков Potato virus A

    		
    >YP_006395324.1 PIPO
    NLLEPVGGFMARVKLFWKISSNKTFAKVLHCGYNCCQARKA
    RRLRRNLRYILSVCTGQTDGILQESSLSGCEWIASPIQQHH
    		

    Подробная информация

    Potato virus A или А вирус картофеля был описан Мерфи и МакКеем в 1932 году. Вирус поражает семейство Пасленовых (Solanaceae). Переносится PVA преимущественно тлями. Широко распространен в картофелепроизводящих районах. Часто встречается в растениях совместно с вирусом PVX. Внешнее проявление заражения вирусом PVA - мягкая мозаика, с осветлением или пожелтением участков листовой пластинки. При сухой и жаркой погоде симптомы обычно не проявляются. Вирус легко может быть обнаружен в соке зараженного табака, но не в соке зараженных растений картофеля[2]. Контроль заболевания - посадка здоровых клубней, уничтожение тлей и зараженных растений, аккуратность при резке, посадке и полевых работах[3].

    Изучение структуры белка капсида [4]

    Группа ученых занималась исследованием строения капсида PVA. Они бомбардировали частицы PVA вируса картофеля термически активированными атомами трития, чтобы определить пространственную доступность аминокислот в составе капсида по внутримолекулярному распределению меченых атомов. Этот метод показал, что 15 аминокислот с N-конца белка и аминокислоты с 27 по 50 являются наиболее доступными для маркировки атомами трития. Из описанных выше экспериментальных данных в сочетании с предсказаниями вторичной структуры элементов и принципов упаковки альфа-спиралей и бета-листов в белках была получена пространственная модель расположения полипептидной цепи белка капсида.

    Источники

    [1] Taxonomy navigation, UniProt
    [2] Potato virus A, Bartels, Phytopath. Z. 21: 395, 1954; etc.
    [3] Вирусные болезни картофеля, С. Н. Еланский
    [4] A Coat Protein Subunits as Assessed by Tritium Bombardment, Ludmila A. Baratova, Aleksander V. Efimov, Eugenie N. Dobrov, Reet Hunt and others.October 2001 vol. 75 no. 20 9696-9702
    [5] HYPERMEDIA EN PROTECTION DES PLANTES, INRA (National Institute for Agricultural Research)

    К семестрам


    © Енькова Анна, 2017