Белок DNA repair protein RecN

Поиск белка

Он был выбран, выполнив запрос по таксономии Citrobacter tructae, и в полученном списке из 6 результатов он имел хороший уровень аннотации а так же имел интересные, нетипичный свойства - рекомбинационный механизм ремонта повреждённой ДНК.

Поисковые запросы

Первый запрос: я решил найти белки со схожими функциями у бактерий рода Citrobacter, поэтому в ячейку Taxonomy я ввел Citrobacter и сделал два keyword: DNA repair и DNA damage. Было получено довольно много результатов (около 3600), что объясняется как распространностью рода, так и важных свойствах выполняемых белком, из-за чего они есть у многих других белков.

Второй запрос: поиск белков со схожими функциями, но близкие по длине. Ключевые слова были те же, но убран поиск по таксономии и добавлен поиск по длине белка (длина белка была 373, а поиск с 350 по 400). Было найдено 360 белков со схожим строением и функциям, что говорит что такой короткий белок нечасто встечатеся (учитывая сколько вариантов было получено при первом поиске).

Третий поиск: поиск белка с такой же функцией у человека. В taxonomy было введено Homo sapiens, key words - те же, добавлена Function: recombinational repair of damaged DNA. К сожалению поиск результатов не дал.