Описание Putative Succinylglutamate Desuccinylase/Aspartoacylase (PDB ID: 3LWU)
Общая структура
Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase — это фермент, катализирующий гидролиз ковалентных связей. Структура 3LWU специфически катализирует реакцию гидролиза N-сукцинил-L-глутамата до сукцината и L-глутамата.
Основные характеристики:
- Состоит из 4 идентичных субъединиц (гомотетрамер)
- Каждая субъединица содержит:
- Полимерную цепь
- Лиганд
- Два иона: цинк (Zn²⁺) и серу (S)
- Вторичная структура: 9 α-спиралей и 17 β-листов
Отдельные цепи
Источник: Бактерия Shewanella frigidimarina (морская протеобактерия)
Идентификатор UniProt: Q088B8
Функция: Металлокарбоксипептидаза, которая:
- Расщепляет эфиры аминокислот с карбоновыми кислотами
- Отщепляет аминокислоты от C-конца полипептида
Особенности:
- Не содержит мутаций относительно референсной последовательности из базы UniProt
- Содержит 69 модифицированных остатков метионина в селенометионин (MSE)
Малые молекулы
В структуре присутствуют следующие малые молекулы:
Описание молекул:
- Zn²⁺: Ион цинка
- SO₄²⁻: Сульфат-ион
- H₂O: Молекулы воды в структуре
Изображение структуры
Рисунок 1. Общий вид структуры белка 3LWU.