Рис. 1. Микрофотография проникновения Bdellovibrio bacteriovorus в хозяина. Ширина рисунка примерно соответствует 4-м микрометрам. Фотография взята с сайта http://microbesftb.com.

Рис.2. Схема жизненного цикла, общего для бактерий рода Bdellovibrio. На первой стадии (Attachment & invasion) бактерия, имеющая единственный жгутик, прикрепляется к пептидогликановому слою добычи, после чего нарушает его целостность и входит в периплазматическое пространство (Penetration). Будучи в нем, паразит заделывает отверстие в мембране и превращает клетку хозяина в сферобласт (spheroblast). Такой агрегат, состоящий из бактерии-паразита и бактерии-хозяина называется бделлопласт (bdelloplast). Используя гидролитические ферменты для разрушения биополимеров хозяина, паразит использует материал клетки хозяина для того, чтобы увеличить длину своего тела и отрастить жгутик (Elongation). Когда ресурсы клетки хозяина истощены, паразит многократно делится, образовавшиеся клетки приобретают подвижность и лизируют стенку клетки хозяина (Lysis) [1]. Весь цикл занимает от одного до трех часов. Схема взята из статьи в википедии по соответствующей теме (http://en.wikipedia.org/wiki/Bdellovibrio).

Геном бактерии Bdellovibrio bacteriovorus, штамм HD100, состоит из одной хромосомы, т.е. из одной двухцепочечной молекулы ДНК. Он описан в записи NC_005363 базы данных RefSeq. Длина генома – 3782950 пар нуклеотидов. В записи приведена последовательность одной из двух комплементарных цепей ДНК.

По данным из записи NC_005363.1, в геноме закодировано 3628 генов. Из них 3586 кодируют белки, остальные 42 кодируют РНК.

Описание оперона АТФ-синтазы в геноме Bdellovibrio bacteriovorus штамм HD100

АТФ-синтаза – белок, состоящий из многих субъединиц, главная функция которого состоит в синтезе АТФ – молекул, аккумулирующих энергию. α-субъединица АТФ-синтазы закодирована на комплементарной цепи, (см. рис. 3, на котором ее ген обозначен atpA).

Рис. 3. Окрестность гена atpA в геноме B. bacteriovorus штамм HD100. Приведен участок хромосомы с координатами 3760000..3776000. Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)

На рис. 3 видны гены, сонаправленные с atpA. Эти гены описаны в таблице 2. Из таблицы 2 следует, что возможный оперон включает 10 белков, 7 из которых описаны как компоненты АТФ синтазы.

Таблица 2. Гены, предположительно входящие в один оперон с геном atpA. Предыдущий и следующий гены имеют ориентацию +1. Они в таблицу не включены.

Источники:

[1] http://en.wikipedia.org/wiki/Bdellovibrio