| Главная |
| Семестры |
| О себе |
| Ссылки |
Описание белка пирофосфогидролазы (pyrophosphohydrolase) из генома бактерии Bdellovibrio bacteriovorus штамм HD100
Информация о белке и его гене, полученная из записи NP_967680.1 базы данных RefSeq с полным геномом бактерии, приведена в таблице 1.
Таблица 1. Информация о пирофосфогидролазе из генома Bdellovibrio bacteriovorus штамм HD100 (идентификатор NP_967680.1 в базе RefSeq)
| Вид информации | Квалификатор в записи генома | Значение |
| Локус гена в геноме | /locus_tag | Bd0714 |
| Имя гена | /gene | mutT |
| Идентификатор гена в базе данных NCBI Gene | /db_xref=”GeneID:…” | 2733897 |
| Начало гена в геноме | - | 672670 |
| Конец гена в геноме | - | 673131 |
| На какой цепи кодируется ген (прямая или обратная) | - | Обратная |
| Длина гена (в парах нуклеотидов) | - | 462 |
| Идентификатор белка в базе данных NCBI Protein | /protein_id | NP_967680.1 |
| Длина белка (в аминокислотных остатках) | - | 153 |
На рис. 1 изображена окрестность в геноме гена описываемого белка. На рис. 2 изображена трехмерная структура белка.
Рис. 1. Геномная окрестность гена белка пирофосфогидролаза из генома бактерии Bdellovibrio bacteriovorus штамм HD100. Ген отмечен черной рамочкой. Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)
Из рисунка 1 следует, что соседние гены сонаправлены с данным. Еще видно, что их рамки считывания перекрываются. Это означает, что этот ген находится в опероне с двумя соседними генами и с их соседними генами.
 |
Рис. 2. Трехмерная структура пирофосфогидролазы из генома бактерии Bdellovibrio bacteriovorus штамм HD100. Анализ структуры белка. Рисунок получен с помощью базы структур белков NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure) |