Главная страница > Второй семестр > Белок GLMS_ECOLI в базах данных SwissProt и TrEMBL
В таблице приведены данные записи P17169 базы данных SwissProt:
Поле | Метка поля | Содержание |
Код доступа ("Accession number") | AC | P17169; P76745 |
Идентификатор последовательности в БД | ID | GLMS_ECOLI |
Название (краткое описание) белка | DE |
glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] Синонимы: EC 2.6.1.16; glucosamine-6-phosphate synthase; hexosephosphate aminotransferase; D-fructose-6-phosphate amidotransferase; GFAT; L-glutamine-D-fructose-6-phosphate amidotransferase |
Дата создания документа | DT |
Создан 01.08.1990 Обновлен 15.12.1998 |
Дата последнего исправления аннотации | DT | 07.02.2006 (68-я версия) |
Название организма | OS | Escherichia coli |
Полное название таксона | OC | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia |
Длина последовательности | SQ | 608 а.о. |
Молекулярная масса белка | SQ | 66763 Да |
Число публикаций, использованных при создании документа | RN | 10 |
Название журнала с самой свежей публикацией | RL | Protein Sci. 8:596-602(1999) |
Описание вторичной структуры | FT | Список элементов вторичной структуры (α-спираль, β-тяж, β-изгиб) с указанными номерами начальных и конечных аминокислотных остатков |
Что содержит поле комментариев? | СС |
Функция белка (участвует в метаболизме гексозаминов) Каталитическая активность (L-глутамин + D-фруктоза-6-фосфат = L-глутамат + D-глюкозамин-6-фосфат) Четвертичная структура (гомодимер) Взаимодействие с другими белками Внутриклеточная локализация (цитоплазма) Сходство с другими белками (принадлежит к семейству SIS, содержит глутаминамидотрансферазный домен 2-го типа) Авторские права |
Какие особенности последовательности указаны? | FT |
Инициирующий аминокислотный остаток (метионин) Полипептидные цепи белка (в данном случае одна полипептидная цепь) Домены (глутаминамидотрансферазный домен) Номера аминокилотных остатков активных сайтов (глутаминамидотрансферазного и изомеризующего) Расхождение с одним из источников (два аминокислотных остатка были определены неверно) Описание вторичной структуры |
Идентификаторы записей PDB | DR | 1JXA; 1MOQ; 1MOR; 1MOS; 1XFF; 1XFG |
В таблице представлены результаты запросов, проведенных с целью выявления белков с тем же кратким описанием, что и GLMS_ECOLI. Наиболее продуктивным оказался запрос по кодовому номеру классификации ферментов (2.6.1.16) он позволил найти 297 документов.
Запрос | Число документов в SwissProt | Число документов в TrEMBL |
Glucosamine-6-phosphate synthase | 145 | 2 |
Glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase | 160 | 105 |
Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase | 0 | 163 |
2.6.1.16 | 160 | 137 |
Hexosephosphate aminotransferase | 155 | 1 |
D-fructose-6-phosphate amidotransferase | 155 | 5 |
GFAT | 160 | 10 |
L-glutamine-D-fructose-6-phosphate amidotransferase | 145 | 4 |
© Куравский Михаил Львович