Главная страница > Второй семестр > Белок GLMS_ECOLI в базах данных SwissProt и TrEMBL  

Белок GLMS_ECOLI в базах данных SwissProt и TrEMBL



    В таблице приведены данные записи P17169 базы данных SwissProt:

Поле Метка поля Содержание
Код доступа ("Accession number") AC P17169; P76745
Идентификатор последовательности в БД ID GLMS_ECOLI
Название (краткое описание) белка DE glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing]
Синонимы: EC 2.6.1.16; glucosamine-6-phosphate synthase; hexosephosphate aminotransferase; D-fructose-6-phosphate amidotransferase; GFAT; L-glutamine-D-fructose-6-phosphate amidotransferase
Дата создания документа DT Создан 01.08.1990
Обновлен 15.12.1998
Дата последнего исправления аннотации DT 07.02.2006 (68-я версия)
Название организма OS Escherichia coli
Полное название таксона OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia
Длина последовательности SQ 608 а.о.
Молекулярная масса белка SQ 66763 Да
Число публикаций, использованных при создании документа RN 10
Название журнала с самой свежей публикацией RL Protein Sci. 8:596-602(1999)
Описание вторичной структуры FT Список элементов вторичной структуры (α-спираль, β-тяж, β-изгиб) с указанными номерами начальных и конечных аминокислотных остатков
Что содержит поле комментариев? СС Функция белка (участвует в метаболизме гексозаминов)
Каталитическая активность
(L-глутамин + D-фруктоза-6-фосфат = L-глутамат + D-глюкозамин-6-фосфат)
Четвертичная структура (гомодимер)
Взаимодействие с другими белками
Внутриклеточная локализация (цитоплазма)
Сходство с другими белками (принадлежит к семейству SIS, содержит глутаминамидотрансферазный домен 2-го типа)
Авторские права
Какие особенности последовательности указаны? FT Инициирующий аминокислотный остаток (метионин)
Полипептидные цепи белка (в данном случае одна полипептидная цепь)
Домены (глутаминамидотрансферазный домен)
Номера аминокилотных остатков активных сайтов (глутаминамидотрансферазного и изомеризующего)
Расхождение с одним из источников (два аминокислотных остатка были определены неверно)
Описание вторичной структуры
Идентификаторы записей PDB DR 1JXA; 1MOQ; 1MOR; 1MOS; 1XFF; 1XFG


   В таблице представлены результаты запросов, проведенных с целью выявления белков с тем же кратким описанием, что и GLMS_ECOLI. Наиболее продуктивным оказался запрос по кодовому номеру классификации ферментов (2.6.1.16) — он позволил найти 297 документов.

Запрос Число документов в SwissProt Число документов в TrEMBL
Glucosamine-6-phosphate synthase 145 2
Glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase 160 105
Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase 0 163
2.6.1.16 160 137
Hexosephosphate aminotransferase 155 1
D-fructose-6-phosphate amidotransferase 155 5
GFAT 160 10
L-glutamine-D-fructose-6-phosphate amidotransferase 145 4


© Куравский Михаил Львович