gatcA.pdb gatcA.out 2 # duplex 16 # number of base-pairs 1 1 # explicit bp numbering/hetero atoms 1 32 0 # 1 | A:...1_:[..G]G-----C[..C]:..32_:B 0.24 0.07 10.52 8.94 -1.12 2 31 0 # 2 | A:...2_:[..A]A-----T[..T]:..31_:B 0.12 0.06 10.51 8.94 -1.26 3 30 0 # 3 | A:...3_:[..T]T-----A[..A]:..30_:B 0.12 0.06 10.51 8.94 -1.26 4 29 0 # 4 | A:...4_:[..C]C-----G[..G]:..29_:B 0.24 0.07 10.52 8.94 -1.12 5 28 0 # 5 | A:...5_:[..G]G-----C[..C]:..28_:B 0.24 0.07 10.52 8.94 -1.12 6 27 0 # 6 | A:...6_:[..A]A-----T[..T]:..27_:B 0.12 0.06 10.51 8.94 -1.26 7 26 0 # 7 | A:...7_:[..T]T-----A[..A]:..26_:B 0.12 0.06 10.51 8.94 -1.26 8 25 0 # 8 | A:...8_:[..C]C-----G[..G]:..25_:B 0.24 0.07 10.52 8.94 -1.12 9 24 0 # 9 | A:...9_:[..G]G-----C[..C]:..24_:B 0.24 0.07 10.51 8.94 -1.12 10 23 0 # 10 | A:..10_:[..A]A-----T[..T]:..23_:B 0.12 0.06 10.51 8.94 -1.26 11 22 0 # 11 | A:..11_:[..T]T-----A[..A]:..22_:B 0.12 0.06 10.51 8.94 -1.26 12 21 0 # 12 | A:..12_:[..C]C-----G[..G]:..21_:B 0.24 0.07 10.52 8.94 -1.12 13 20 0 # 13 | A:..13_:[..G]G-----C[..C]:..20_:B 0.24 0.07 10.52 8.94 -1.12 14 19 0 # 14 | A:..14_:[..A]A-----T[..T]:..19_:B 0.12 0.06 10.51 8.94 -1.26 15 18 0 # 15 | A:..15_:[..T]T-----A[..A]:..18_:B 0.12 0.06 10.51 8.94 -1.26 16 17 0 # 16 | A:..16_:[..C]C-----G[..G]:..17_:B 0.24 0.07 10.53 8.94 -1.12 ##### Base-pair criteria used: 4.00 15.00 2.50 65.00 4.50 7.50 ##### 0 non-Watson-Crick base-pairs, and 1 helix (0 isolated bps) ##### Helix #1 (16): 1 - 16