Альфа-спирали
| # | Имя атома | Длина связи (Å) | Угол N-H-O () | 1 | N(169ALA)- O(165PRO) | 2.94 | 156.8 |
|---|---|---|---|
| 2 | N(187ASP)- O(183ARG) | 2.94 | 160.1 |
| 3 | N(185ALA)- O(181ARG) | 2.95 | 161.8 |
Бета-тяжи
| # | Имя атома | Длина связи (Å) | Угол N-H-O () | 1 | N(122VAL)- O(135LEU) | 2.93 | 166.9 |
|---|---|---|---|
| 2 | N(118SER)- O(121GLY) | 2.77 | 152.0 |
| 4 | N(118SER)- O(121GLY) | 2.93 | 151.0 |
В среднем длина связи составляет 2.94 Å в альфа-спиралях и 2.87 Å в бета-листах. Длина водородной связи в альфа-спиралях 2.990.1, а в бета-листах 2.910.14 . Для альфа спирали характерен угол 144-166, а антипараллельных бета-листов 150-170. Величины полученные мной и представленные в таблице входят в данные диапозоны из литературы.
Baker, E. N., & Hubbard, R. E. (1984). Hydrogen bonding in globular proteins. Progress in Biophysics and Molecular Biology, 44(2)