Canis lupus (серый волк) – вид хищных млекопитающих из семейства псовых. Волк является самым крупным видом семейства псовых и вторым по величине хищником в Европе после бурого медведя. Волки предпочитают лесистую местность и выбирают для жилья равнинные или горные участки с негустой растительностью и умеренным климатом. Волки встречаются в большинстве районов Европы и Азии, а также на территории Северной Америки.
Число сборок генома | 17 |
---|---|
Assembly name | mCanLor1.2 |
GenBank assembly accession | GCA_905319855.2 |
Общая длина | 2,447,463,909 |
Число контигов | 248 |
Число скэффолдов | 82 |
N50 скэффолдов | 65,778,685 |
L50 скэффолдов | 15 |
N50 контигов | 34,375,412 |
L50 контигов | 25 |
L50 контигов | 25 |
Ссылка на последовательность одного из контигов | CAJNRB020000020.1 |
Запрос | (20000:30000[Sequence Length]) AND Podoviridae[Organism] AND complete genome |
---|---|
количество находок в GenBank\RefSeq | 23\6 |
AC | NC_019931 |
Название вируса | Helicobacter phage KHP40 |
Taxonomy | Viruses; Duplodnaviria; Heunggongvirae; Uroviricota; Caudoviricetes; Caudovirales; Podoviridae; Schmidvirus. |
TaxID | 1987150 |
Taxonomy | Viruses; Duplodnaviria; Heunggongvirae; Uroviricota; Caudoviricetes; Caudovirales; Podoviridae; Schmidvirus. |
Тип генома | Circular dsDNA |
Virus host | Helicobacter pylori |
CDS | ссылка |
Последовательность получения CDS файла: "Send to: Coding Sequence" –> "Format FASTA Nucleotide" –> "Create File"
sig_peptide участок, кодирующий сигнальный пептид
AC: NM_001112800
sig_peptide 212..316 /gene="SLC8A1" /gene_synonym="NCX1" /inference="COORDINATES: ab initio prediction:SignalP:4.0"
mat_peptide последовательность, кодирующая зрелый пептид или белок
AC:NG_047042
join(57969..58073,61212..61284,65929..66038,66159..66356, 70918..70995) /gene="CDC42" /gene_synonym="CDC42Hs; G25K; TKS" /product="Cell division control protein 42 homolog. /id=PRO_0000030425" /note="propagated from UniProtKB/Swiss-Prot (P60953.2)"
ncRNA последовательность, не кодирующая белок; в результате транскрипции образуется РНК отличная от тРНК и рРНК
AC:NG_011594
ncRNA complement(join(58796..60991,62151..62254,65569..65745)) /ncRNA_class="lncRNA" /gene="DIAPH1-AS1" /product="DIAPH1 antisense RNA 1" /transcript_id="NR_038333.1" /db_xref="GeneID:100505658" /db_xref="HGNC:HGNC:40177"
operonпоследовательность, с которой транскрибируется полицистронная РНК
AC:AJ271079
operon 77233..82753 /operon="psbB"
regulatoryучасток последовательности, который регулирует процессы транскрипции, трансляции, репликации, а также укладку хроматина.
regulatory 10465..10470 /regulatory_class="polyA_signal_sequence" /gene="DICER1" /gene_synonym="aviD; DCR1; Dicer; Dicer1e; GLOW; HERNA; K12H4.8-LIKE; MNG1; RMSE2" /note="hexamer: AATAAA"