Филогенетические деревья

Отобранные бактерии

Из предложенных в задании бактерий были выбраны 7 бактерий, представленные в таблице 1

Таблицa 1. Отобранные актинобактерии
Название Мнемоника
1 Leifsonia xyli

LEIXX
2 Clavibacter michiganensis

CLAMS
3 Bifidobacterium longum

BIFLO
4 Streptomyces avermitilis

STRAW
5

Thermobifida fusca

THEFY
6

Mycobacterium leprae

MYCLE
7

Corynebacterium diphtheriae

CORDI

Скобочная формула дерева

(((STRAW, THEFY),((LEIXX, CLAMS), BIFLO)), (MYCLE, CORDI));

Изображение дерева

Кекс
Рис.1 Филогенетическое дерево выбранных бактерий

Список нетривиальных ветвей

  1. {LEIXX, CLAMS} vs {BIFLO, STRAW, THEFY, MYCLE, CORDI}
  2. {LEIXX, CLAMS, BIFLO} vs {STRAW, THEFY, MYCLE, CORDI}
  3. {STRAW, THEFY} vs {LEIXX, CLAMS, BIFLO, MYCLE, CORDI}
  4. {LEIXX, CLAMS, BIFLO, STRAW, THEFY} vs {MYCLE, CORDI}

Учет таксономии

Таблицa 2. Таксономия отобранных бактерий
Название Мнемоника
1 Leifsonia xyli

Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Micrococcales; Microbacteriaceae; Leifsonia

2 Clavibacter michiganensis

Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Micrococcales; Microbacteriaceae; Clavibacter

3 Bifidobacterium longum

Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Bifidobacteriales; Bifidobacteriaceae; Bifidobacterium

4 Streptomyces avermitilis

Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Kitasatosporales; Streptomycetaceae; Streptomyces

5

Thermobifida fusca

Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Streptosporangiales; Nocardiopsaceae; Thermobifida

6

Mycobacterium leprae

Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Mycobacteriaceae; Mycobacterium

7

Corynebacterium diphtheriae

Bacteria; Terrabacteria group; Actinomycetota; Actinomycetes; Mycobacteriales; Corynebacteriaceae; Corynebacterium

Все выбранные бактрерии, как и ожидалось, принадлежат классу Actinomycetes. При этом есть две ветви выделяющие таксоны: ветвь {LEIXX, CLAMS} соответствует порядку Micrococcales, ветвь {MYCLE, CORDI} соответствует порядку Mycobacteriales.