Скрипт для получения изображений
Альфа+бета структура
Количество альфа-спиралей - 17, бета-складок - 44, бета-поворотов - 47. Видимая беспорядочность структуры позволяет сделать вывод, что это альфа + бета структура.
Для исследования выбраны &alpha спираль a.o. c по 288-300, &beta тяж - 352-360 и соседние с ним: 345-349 и 374-381, &beta поворот 202-205.
&beta атомы могут лежать по обе стороны от плоскости тяжа. В спирали они направлены в разные стороны.
В остове &alpha спирали водородные связи образуются, например, между кислородом из 288-го остатка и азотом из 292-го, кислородом из 291-го и азотом из 295-го. . и другими. Вообще говоря,разность номеров соответствующих аминокислотных остатков, как правило, равна 4.
Изображения спирали в ленточной и остовной моделях, с бета-атомами и без них.
Изображения листов:
Изображение петли и водородной связи, скрепляющей поворот. Последовательность аминокислотных остатков, образующих поворот - ser202, asp203,ser204, ser205.