Построение дерева бактерий
Для выполнения данного практикума были взяты восемь бактерий (см. таблицу), затем на основании выданного дерева было построено
его "поддерево" путем удаления не интересующих нас бактерий. Получилась скобочная формула:
(((((PSEMY, PSEAE), SACD2), YERPE), (THIDA, AROAE)), (ROSDO, BARHE));
| Мнемоника | Название бактерии |
|---|---|
| BARHE | Bartonella henselae |
| ROSDO | Roseobacter denitrificans |
| AROAE | Aromatoleum aromaticum |
| THIDA | Thiobacillus denitrificans |
| YERPE | Yersinia pestis |
| SACD2 | Saccharophagus degradans |
| PSEAE | Pseudomonas aeruginosa |
| PSEMY | Pseudomonas mendocina |
Нетривиальные ветви бактерий:
1. Pseudomonadales: {PSEMY, PSEAE} против {SACD2, YERPE, THIDA, AROAE, ROSDO, BARHE}
2. {PSEMY, PSEAE, SACD2} против {YERPE, THIDA, AROAE, ROSDO, BARHE}
3. Gammaproteobacteria: {PSEMY, PSEAE, SACD2, YERPE} против {THIDA, AROAE, ROSDO, BARHE}
4. Betaproteobacteria: {PSEMY, PSEAE, SACD2, YERPE, ROSDO, BARHE} против {THIDA, AROAE}
5. {PSEMY, PSEAE, SACD2, YERPE, THIDA, AROAE} против {ROSDO, BARHE}
Я так понимаю, что на момент создания той систематики, которая находится на сайте NCBI, не было
данных о том, какие таксоны раньше отделились, а какие похже, поэтому там есть не только дихотомическое ветвление,
поэтому мы не можем ничего сказать про названия 2 и 5 нетривиальных ветвей.
