Базы данных

Я решил поработать с белком ELOVL1, потому что из этих букв можно собрать мою фамилию. Звучит, конечно, слегка эгоцентрично, но дело не в этом)

Осуществив поиск по базе данных KEGG, я узнал общую информацию относительно этого белка. Этот белок участвует в удлинении хвостов жирных кислот, причем очень длинных хвостов. Его мнемоническое название расшифровывается как Elongation of very long chain fatty acids protein 1. Относится этот белок к трансферазам, переносящим ацильные группы (кроме аминоацильных). А еще более точно - очень-длинно-цепочечная 3-оксоацил-КоАсинтаза (EC:2.3.1.199). Ассоциации этого белка с какими-то болезнями, лекарствами в KEGG не найдено.

Поиск по БД Human protein atlas показал, что все-таки этот белок как-то связан с болезнями, является потенциальным таргетным белком для неких лекарств. Однако, подробностей никаких нет.

**Рис. 1** Предсказанная структура белка EVOLV1. Данные с сайта Human protein atlas. Преобладание синего цвета указывает на то, что по большей части структура предсказана достаточно "уверено".

Тканеспецифичности у него нет. Синтезируется почти везде. В небольших количествах синтезируется в сетчатке глаза. Не обнаружен в клетках скелетных мышц, хвостатом ядре головного мозга, шейке матки и некоторых еще частях тела. В клетках он обнаружен в ЭПР, что, в целом, понятно.

Для того, чтобы определить с какими еще белками может быть так или иначе связан мой, я обратился к базе данных STRING, где поиск осуществил по белкам человека. Полученный граф (Рис. 2) содержал еще два белка из моего изначального списка - ELOVL2 и HSD17B12. Странно, что не представлены остальные белки из семейства ELOVL, которых только в списке ID из задания 7, а вообще их может быть еще больше

**Рис. 2** Граф наиболее значимыхх взаимосвязей белка ELOVL1 с другими белками