Учебный сайт Кузнецовой Марии

Главная

Первый семестр

Второй семестр

Третий семестр

Ссылки

Об авторе

Гидрофобный кластер атомов в структуре белка CysZ (идентификатор PDB 3TX3) из генома бактерии Idiomarina loihiensis штамм L2TR

Гидрофобные взаимодействия наряду с водородными являются основными структурными взаимодействиями в белке. Рассмотрим расположение гидрофильных и гидрофобных молекул в белке CysZ.

На рис. 1 приведена структура CysZ с учетом гидрофобности тех или иных аминокислот.
Синим цветом показаны гидрофобные аминокислоты, красным - гидрофильные.
Гидрофобные аминокислоты - это аланин, лейцин, пролин, изолейцин, валин, триптофан, тирозин, фенилаланин, глицин.
Гидрофильные - серин, треонин, лизин, аргнин, аспарагиновая кислота, глутаминовая кислота, глутамин, аспарагин.
Как видно из рисунка, белок по сути представляет собой центральную гидрофобную область - гидрофобное ядро и торчащие из него гидрофильные остатки аминокислот.



Рис. 1. Расположение гидрофильных и гидрофобных молекул в белке CysZ.