Поисковые системы

На главную Назад

1. При вводе ID моего белка в окошко поиска все поисковые системы чётко вывели мне мой белок PURC_ECOLI. При вводе AC моего белка SRS и UniProt снова нашли только один мой белок, а вот с MRS оказалось не так: было выведно 34 записи по моему запросу, где под номером 2 оказался мой белок, при этом в графе Title в строке References только у моего белка была ссылка на pdb. Анализируя поле Features хочется заметить, что в MRS при наведении курсора на элемент вторичной структуры, в поле Sequence information, где представлен мой белок в fasta формате, выделяются чертой или линией соответствующие аминокислотные остатки, что, как мне кажется, очень удобно. В SRS и UnitProt имеется графическая схема вторичной структуры, при наведении курсора на элемент которой выводится его позиция. Из 2 представленных схем мне больше понравилась схема, представленная UniProt (просто она больше по размеру, а иформация и там и там одинаковая). Ещё в UniProt и SRS вверху есть ссылки на поля, в MRS такого нет, врочем каму как нравится.

2. На "gam" называются следующие таксоны:
gambusia
gammaherpesvirinae
gammapapillomavirus
gammaproteobacteria
gammaretrovirus
gammaridea
Английским эквивалентом слова "гамма-протеобактерия" является слово "gammaproteobacteria".
В банке SwissProt 83513 записей, описывающих белки из гамма-протеобактерий.
3.

Запросы

Формулировка функции белка	Строка запроса	Количество найденных документов
Dihydroorotase	([swissprot-Taxonomy:Gammaproteobacteria] & [swissprot-Description:Dihydroorotase])	88
DHOase	([swissprot-Taxonomy:Gammaproteobacteria] & [swissprot-Description:DHOase])	85

Результаты поиска, сохранённые в fasta формате, находятся здесь.