Семейство Доменов


На главную Назад
Доменная организация белка PYRC_ECOLI.
Схематическое изображение доменной структуры PYRC_ECOLI (взята из базы данных Pfam):
Домены, отмеченные на пространственной структуре PYRC_ECOLI, идентификатор PDB1j79

Идентификатор Pfam
Название записи
Полное название домена
Положение в последовательности Glya_Ecoli
PF01979
DHO
Амидогидролаза
1 - 345

Краткое описание N-концевого домена белка PYRC_ECOLI
Относится к семейству гидролаз. Это семейство включает аденин-деаминазу, которая гидролизирует аденин из гипоксантина и аммиака. Реакции аденин деаминазы очень важны для использования аденина, пурина как источник азота. Также в это семейство входит дегидроротаза и N-ацетилгликозамин -6-фосфат деацетилазы. Эти энзимы катализируют реакцию N-ацетил-D-гликозамин 6-фосфата + H2O <=> D-гликозамин 6-фосфат + ацетат. Также в это семейство входит домен альфа-субъединиц уреазы.

Организмы, в которых найдены белки с доменами PF01979
Таксон
Количество белков с доменом PF01979
Эукариоты Растения 35
Грибы 140
Животные 190
Бактерии   3335
Археи   187

Известо всего 4259 белка с доменом PF01979. Обычно стречается в сочетании с другими доменами. Случаи дупликации домена PF01979 неизвестны (во всех архитектурах домен PF01979 встречается один раз). Известен один случай перестановки двух доменов местами (перестановки вида Zn_clus, Fungal_trans, Amidohydro_1 и Amidohydro_1, Zn_clus, Fungal_trans), также имеются последовательности, в которых домен "разрывается" на 2-3 части.
Мотивы в аминокислотной последовательности PYRC_Ecoli по данным БД InterPro.
Картинка с изображением всех подписей в белке:
Табличка "Мотивы в белке PYRC_ECOLI по данным БД InterPro"
Название подписи Положение в последовательности PYRC_Ecoli Полное название базы данных Название организации, поддерживающей данную БД Город и страна
DIHYDROOROTASE_1 15-23 PROSITE
DIHYDROOROTASE_2 249-260 PROSITE
DHOdimr 4-384 PIR(Protein Information Resource)
pyrC_dimer 7-347 Comprehensive Microbial Resource
Amidohydro_1 5-348 Pfam
G3DSA:3.20.20.140 2-348 Gene3D
SSF51556 5-347 Superfamily

©Базылев Сергей, 2007