Визуализация молекул в Jmol

Выводы:

В ходе мини исследования мы выяснили , что длины водородных связей в Бетта-листах в среднем составляют 0.289 nm, в Альфа-спиралях 0.296 nm

Углы в водородных связях в идеале стремятся к 180 градусам , однако среднее значение составляет 156 градусов, но, в отличии от длин водородных связей существует существенный разброс - от 173 до 153, крайне редкий случай - 112 (мое предположение состоит в том, что выдающийся из статистики угол вызван тем , что атом trp117:a.o образует 2 водородные связи)

Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре

Имена атомов

Длина связи N-O (nm)

Угол связи N-H-O (Градусы)

Бетта листы

1 [leu]78:a.n - [val]141:a.o 0.289 152.8
2 [val]141:a.n -[ile]76:a.o 0.289 163.2
3 [ile]76:a.n -[arg]139:a.o 0.287 161.0
4 [thr]143:a.n - [leu]78:a.o 0.284 153.5
5 [phe]80:a.n -[thr]143:a.o 0.294 161.4

Альфа спирали

1 [gln]126:a.n -[asp]122:a.o 0.317 161.9
2 [trp]117:a.o -[ala]121:a.n 0.286 112.3
3 [val]120:a.n -[trp]117:a.o 0.300 153.6
4 [arg]125:a.n -[ala]121:a.o 0.277 166.7
5 [val]120:a.o -[leu]124:a.n 0.301 173.6