Задание 1

Blattella germanica

Рыжий таракан является одним из самых распространенных видов синантропных насекомых. Проживая в жилых и хозяйственных помещениях он ведет ночной образ жизни и питается преимущественно остатками человеческой пищи. Продолжительность жизни взрослой особи может достигать 20-30 недель.

Таблица параметров сборки

Число сборок генома 2
Выбранная сборка Bger_1.1
AC (RefSeq) GCA_003018175.1
Assembly level Scaffold
Общая длина 2,037,297,555
Число контигов 317,827
N50 контигов 12,126
L50 контигов 39,325
Число скэффолдов 24,818
N50 скэффолдов 1,056,071
L50 скэффолдов 576
BioProject PRJNA427252
Последовательность контига

PYGN01013424.1

Задание 2

Запрос в базу Nucleotide:

(complete genome AND (Tectiviridae[Organism]) AND 10000:20000[Sequence Length]))

Найдено 33 записи

Таблица параметров генома вируса

AC MZ150790
Латинское название Microbacterium phage Badulia
TaxID 2836047
Тип генома Линейный, ДНК, 1 цепь
Хозяин Microbacterium testaceum NRRL B-24232
CDS

fasta

В левом верхнем углу кнопка "Send to", выбираем "Coding seqences" и сохраняем

Задание 3

Описание ключей локальных особенностей

intron

Участок ДНК, который после транскрипции вырезается из мРНК в ходе процессинга

AC: KC731473

exon

Участки РНК, соединение которых дает зрелую мРНК

AC: AF312366

gap

Промежуток между двумя компонентами сборки ориентировочной длины

AC: AB540029

iDNA

Участок ДНК, утраченный в процессе рекомбинации

AC: MH388468

centromere

Участок хромосомы, учавствующий в присоединении веретена деления

AC: NC_001148