Заданный PDB файл: 1KQF.
Thr14:b, Asn15:b, Ser16:b, Ile17:b, Lys258:b, Pro259:b, Ala263:b, Phe265:b, Ile266:b, Ala267:b, Phe269:b, Val22:c, Phe25:c, Phe26:c, Ala29:c, Leu30:c, Ile33:C, Phe36:c, Phe37:c, Pro38:c, Thr39:c, Leu40:c, Ile163:c, Ile166:c, Leu167:c, Met170:c (запись из файла).
Изображение лиганда с остатком Phe36:c
![]()
В данной молекуле в цепи С струтура представлена в остновном из альфа-спиралей.
![]()
- Все атомы, относящиеся к остаткам данного элемента вторичной структуры.
- Все атомы кислорода и азота остатков данного элемента.
- Все атомы углерода и серы из боковых цепей остатков данного элемента.
- Все атомы кислорода и азота из остатков белка ВНЕ данного элемента (в том числе из других полипептидных цепей).
- Все атомы углерода и серы из боковых цепей остатков белка вне данного элемента (в том числе из других полипептидных цепей).
- Все атомы кислорода и азота остатков данного элемента, образующие водородные связи с атомами кислорода или азота остатков вне данного элемента (водородной связью считаем расположение центров двух атомов на расстоянии менее 3,7A).
- Все атомы остатков данного элемента, участвующие в гидрофобных контактах с остатками вне данного элемента (гидрофобным контактом считаем такое расположение двух неполярных атомов, что расстояние между их центрами меньше 5A; неполярными считаем все атомы углерода и серы из боковых цепей.