TMHMM result

HELP with output formats


# sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8 Length: 300

# sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8 Number of predicted TMHs:  6

# sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8 Exp number of AAs in TMHs: 125.91911

# sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8 Exp number, first 60 AAs:  44.16728

# sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8 Total prob of N-in:        0.99549

# sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8 POSSIBLE N-term signal sequence

sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8   TMHMM2.0       inside       1    11

sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8   TMHMM2.0       TMhelix     12    34

sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8   TMHMM2.0       outside     35    37

sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8   TMHMM2.0       TMhelix     38    60

sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8   TMHMM2.0       inside      61    79

sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8   TMHMM2.0       TMhelix     80   102

sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8   TMHMM2.0       outside    103   116

sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8   TMHMM2.0       TMhelix    117   139

sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8   TMHMM2.0       inside     140   157

sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8   TMHMM2.0       TMhelix    158   175

sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8   TMHMM2.0       outside    176   179

sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8   TMHMM2.0       TMhelix    180   199

sp_A1JHZ2_FIEF_YERE8   TMHMM2.0       inside     200   300

 

TMHMM

# plot in postscript, script for making the plot in gnuplot, data for plot


© 2010 Borisova Marina