Работа с файлом 1JFS.
а) поверхности контакта мономера белка с симметричным мономером на фоне остовной (ribbon) модели мономера;
б) поверхности контакта димера белков с двойной спиралью ДНК на фоне остовной модели части белка, вовлечённой в контакт;
в) поверхности контакта ДНК с димером белков на фоне проволочной (sticks) модели двойной спирали.
Площадь контакта: 2551.62 A2.
Часть этой площади, которая приходится на гидрофобные взаимодействия: 42.72%.
а) одной из цепей 1KQF
В большинство методов выделяют один единственный домен в изучаемом белке. Действительно, цепь белка представляет собой плотный шарик. Поэтому, если делить его на домены, то наиболее доставерно получается с помощью метода SCOP.
![]()
б) цепи белка из упр. 1.
Большинство методов выделяет 3 домена. И действительно это так:
На данном изображении была сделана раскараска по доменам выделеным с помощью метода CATH.