Я нашла в сервисе Pfam домен ALAD и скачала выравнивание 30 последовательностей. Далее множественное выравнивание было "приведено в порядок": удалены последовательности с протяженными вставками или делециями в середине, колонки из одних гэпов и т.д. В результате получилось множественное выравнивание из 9 последовательностей, в котором нашлось 4 консервативных блока:
Блок | Длина блока (а.о.) | Процент консервативных колонок(%) |
BLOCK1 | 15 | 100 |
BLOCK2 | 15 | 80 |
BLOCK3 | 52 | 67,3 |
BLOCK4 | 47 | 66 |
BLOCK1
BLOCK2
BLOCK3
BLOCK4
Проект в Jalview
Найденные блоки находятся на достаточном близком расстоянии(не превышает 27 а.о.), что свидетельствует о гомологичнсти всех последовательностей, входящих в выравнивание.