| Download script |
Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структурe
| # | Имена атомов | Длина связи (Å) | Угол N-H-O (°) |
| Альфа-спирали | |||
|---|---|---|---|
| 1 | N(129ARG)- O(125SER) | 3.00 | 158.4 |
| 2 | N(130LEU)- O(126ILE) | 2.93 | 143.6 |
| 3 | N(127ALA)- O(123LEU) | 3.01 | 165.4 |
| Бета-тяжи | |||
| 1 | N(240VAL)- O(405ALA) | 2.96 | 156.6 |
| 2 | N(405ALA)- O(240VAL) | 2.91 | 168.1 |
| 3 | N(244SER)- O(401THR) | 2.97 | 153.5 |
В альфа-спирали(на основе полученных данных):
Средняя длина водородной связи= 2.98А
Средний угол водородной связи= 155.8
В бета-тяжах (на основе полученных данных):
Средняя длина водородной связи= 2.95А
Средний угол водородной связи= 159.4
Полученные длины водородных связей согласуются с ожидаемыми данными(2.5-3.2A)[1],рассматриваемые углы (155.8 и 159.4) также близки к идеальным(180)[2].
[1]http://biomodel.uah.es/en/water/hbonds.htm - длина водородной связи
[2]Definition of the hydrogen bond(IUPAC Recommendations 2011) - угол водородной связи