Изучение влияния мутаций на аминокислотную последовательность белка
В данном практикуме была получена аминокислотная последовательность белка ACF11151.1, а также с помощью команды EMBOSS seqret нуклеотидная последовательность,
кодирующая данный белок. В рамках изучения влияния генных мутаций на аминокислотную последовательность белка были сделаны 11 мутантных нуклеотидных последовательностей днк, которые затем транслировались
в аминокислотную последовательность с помощью программы transeq и выравнивались с исходной последовательностью в программе needle
Полученные результаты приведены в excel-таблице
Какие выводы можно сделать исходя из проделанной работы?
- Спасибо избыточности генетического кода, т.к. не всегда замена нуклеотида приводит к замене аминокислоты. Хотя бывают случаи, когда замена всё-таки происходит и появляется другая аминокислота, возможно имеющая противоположные свойства, то такие мутации могут приводить к изменению в структуре белка и следовательно его функции.
- Делеция одного нуклеотида или вставка нуклеотидов приводит к сдвигу рамки считывания и далее к трансляции поломанного белка, синтез которого довольно быстро остановится из-за быстро возникающих в результате мутации стоп-кодонов.
- Возникновение стоп-кодона приводит к завершению трансляции, и следовательно к синтезу короткого белка, не способного выполнять свои функции
Источники:
1)https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/ACF11151.1-исследуемый белок
2)https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/CP001099.1- геном бактерии, которой принадлежит белок